Fick precis tredje utgåvan av The Handbook of Science and Technology Studies. Börjar bläddra - och hamnar direkt i framtiden: “©2008 Massachusetts Institute of Technology” står det på titelbladets baksida …
Archive for the 'vetenskap' Category
The Director of the National Institutes of Health shall require that all investigators funded by the NIH submit or have submitted for them to the National Library of Medicine’s PubMed Central an electronic version of their final, peer-reviewed manuscripts upon acceptance for publication to be made publicly available no later than 12 months after the official date of publication: Provided, That the NIH shall implement the public access policy in a manner consistent with copyright law.
Peter Suber skriver om den “bill” som precis gått igenom kongressen och som bland annat innebär att man arkiverar manuskripten i open access-databasen PubMed Central (och inte nödvändigtvis i OA-tidskrifter, som bland annat Nature fick det till.)
Science offentliggjorde för en tid sedan vinnarna i “2007 Visualization Challenge Winners” och, precis som Thomas, var jag väl lite icke-imponerad. Kanske är det mina barns pågående intresse för naturalhistoria - de har byggt om en del av lägenheten till ett museum - eller nåt, men jag tycker det här är mycket coolare än de bilder som Science valde ut:
(Bild: The University of Manchester.)
Tekniken heter Very High Resolution X-Ray Computed Tomography och den har använts för att studera en 50 miljoner år gammal spindel. Såhär beskriver forskarna hur det gick till:
The specimen was scanned at Ghent University’s High Resolution Micro-Tomography Facility (UGCT: http://www.ugct.ugent.be) using a Feinfocus nano-focus transmission type X-ray tube set at a voltage of 60 kVp and a spot size of 1 mm. The X-ray detector was a Photonic Science X–Ray Imager-VHR 1:1 CCD camera system with straight fibre-optic coupling to a gadolinium oxysulphide scintillator (5 mg/cm2), resulting in a sensitivity for X-rays between 5 and 35 keV. The sample manipulator featured 7 axes, including a high precision air bearing rotation stage (MICOS, UPR160F-AIR) and a XY piezo stage with 50 nm resolution and 20 mm travel range for accurate centring on the axis of rotation. The complete tomography setup was controlled with LabView based software. A series of 800 projections of 1002 x 667 pixels (each 36 μm2) was recorded covering a field of view of 2.7 mm over 360 degrees. Each projection angle was exposed three times over 1.5 seconds.
Låter som om de haft kul i labbet.
Pressmeddelandet finns här, pdf-en av pappret Penny et al. 2007, “First fossil Micropholcommatidae (Araneae), imaged in Eocene Paris amber using X-Ray Computed Tomography”, Zootaxa 1623: 47-53 finns här och här finns en större bild.
[via Greg Laden.]
Det finns en “bill” i amerikanska senaten som kommer leda till att forskare med finansiering från NIH publicerar sina resultat i open access-tidskrifter. I går kväll gick den igenom med klara röstsiffror men det finns fortfarande presidentveto och annat att taktisera kring.
Greg Laden har tröttnat på James Watsons dumheter och skäller ut honom efter noter, bland annat genom att använda det i offentliga slagsmål så sällan sedda men här snyggt levererade vetenskapshistoriska kontextualiseringsargumentet. Veckans bloggpost, alla kategorier.
Science museum ställde in, men bloggosfären levererade kritisk diskussion ändå.
[via PZ Myers.]
“Living properties: Making knowledge and controlling ownership in the history of biology” är titeln för en spännande workshop vid Max Planck-institutet för vetenskapshistoria 29-31 maj 2008, organiserad av Jean-Paul Gaudillière, Daniel Kevles och Hans-Jörg Rheinberger.
The history of intellectual property has drawn increasing attention in the history of science. A vast corpus of literature including histories of the political, economic, and legal frameworks of innovation, histories of particular technologies, histories of specific enterprises and their R&D investments have been accumulating in recent decades. This literature has addressed the development of the world’s patent systems and explored the existence of arrangements for intellectual property protection outside the patent system such as trade secrets. It has also provided valuable information on the norms and understanding of patenting activities associated with the production and commercialization of products ranging from mechanical devices to therapeutic methods. It has also demonstrated that forms of intellectual property are the product of fragile compromises that have radically changed through time. Ideas of intellectual property and how to protect it have been revealed as features of broad systems of political economy, closely connected to the production and appropriation of the product itself and expressing a variety of means of control, certification and valorization. These systems have promoted the establishment of boundaries between private and common goods that are both real and historically contested.
Läs resten av CFP:et på Biomedicine on display. Sista datum för abstracts: 1 november.
Läste Vernon Bogdanors recension av Sheri Berman, The Primacy of Politics: Social Democracy and the Making of Europe’s Twentieth Century (Cambridge University Press) (TLS 13 juli). Ännu en i raden av böcker man vill läsa, helt klart.
Update: här finns Crooked timbers seminarium om Berman.
In the mid-1990s an experiment investigating the acoustic tomography of ocean climate aspired to provide definitive proof of global warming. The experiment was stopped by environmentalists who thought it would harm marine mammals. The talk explores what the speaker terms the Cold-War Legacy and how oceanographers who built their science on US Navy support for studying the ocean as a theatre of warfare were not credible in their role as scientists studying the ocean as an environmental issue and an abode of life. The argument is based in part on comments collected during public hearings on the matter, which illustrate very clearly that the American public did not trust these scientists. Many believed that global warming was already proven, while others believed the scientists were simply opportunists seeking to advance their own careers, but the most damning critique was the accusation that the experiment to demonstrate global warming was simply a “cover story” to hide a secret military project.
Intressant seminarium med Naomi Oreskes på Niels Bohr-arkivet, Köpenhamn, imorgon torsdag. Mer information här.
Betaversionen av Libris innehåller ett antal nyheter. En som jag tycker verkar lovande är möjligheten att prenumerera på sökningar i RSS/Atom-format. Forskningslitteraturen är ett någorlunda föränderligt landskap, och RSS/atom brukar ju fungera bra när det gäller att hålla koll på föränderligt webbinnehåll.
Lunds universitetsbibliotek har en elektronisk tjänst som heter Elin, ett slags interface mot tidskrifter, databaser och annat. Man har sitt eget Elinkonto där man kan spara olika saker. En sak som jag gillar med Elin är möjligheten att ställa in automatiska sökningar på begrepp, keywords, författare, bevaka vissa tidskrifter och så vidare. Elin gör automatiskt sökningar i de stora mängder tidskriftsmetadata som finns och signalerar när det dykt upp något nytt papper inom den egna sekten den teoribildning man tillhör, av ens guru någon av fältets ledande forskare och så vidare. Perfekt för den som vill lägga fingret på forskningslitteraturens puls (yes - där satt den, metaforen!).
Problemet är bara att resultaten lassas över till oss användare som e-post. Hade gärna sett att man, som i betaversionen av Libris, istället kunde hålla koll på flödet av papers i Elin via RSS-läsare. Föreslog den här funktionaliteten för en tid sedan, men det verkar inte ha hänt något.
Det är alltid roligt när duktiga studenter går vidare till att bli doktorander. Två FPI-alumner från vår kurs de senaste terminerna: Anna Åberg, som skrev sin uppsats om cyborgs, antogs nyligen som doktorand i teknikhistoria på KTH. Thomas Lennartsson, som skrev sin uppsats om patentering inom genteknik, är numera doktorand i astrofysik vid Lunds universitet.
Lycka till till er bägge!
Jag gillar böcker om forskningshantverket, som Howard S. Beckers Writing for Social Scientists, densammes Tricks of the Trade: How to Think About Your Research While You’re Doing It, Ludmila Jordanova, History in Practice med flera. Eszter Hargittai håller på att färdigställa en ny bok i samma genre:
the chapters in this book provide helpful behind-the-scenes accounts of doing empirical social science research for a wide range of methods such as use of secondary large-scale data sets, interviews, observations, experiments and historical documents. The unique contribution of this collection is that it provides readers with a realistic idea of what to expect when embarking on empirical investigations by offering richly detailed descriptions of the logistics of individual research projects.
Se även kommentarerna till det här inlägget (även om de lutar alldeles för mycket åt det kvantitativa hållet för att det ska vara relevant för min forskarvardag).
Twitter eller Jaiku? Kommer den frågan att adderas till raden av klassiska som Mac eller PC? Netscape eller Internet Explorer? Movable Type eller Wordpress? Eller kommer den här mikroblogging/social apps (eller vad fan man nu ska kalla det) med utväxter åt mobilhållet (pragmatisk användning av urgamla protokollet SMS) att bli sommarens fluga, den där som surrar så envetet och sen hittas död innanför fönstret när hösten kommer?
Inte vet jag. Men Åsk, Erik, Steffanie, Jonas och andra early adopters, de där som började blogga runt 2001 eller ännu tidigare, twittrar och jaikuar. Litet tecken, kanske? Att Jyri Engeström ligger bakom Jaiku är ett annat.
Och något slags connection verkar finnas till Nokia; Widsets har växt fram ur Nokias inkubator NVO och de har nu programmerat en Jaikuklient.
Novo Nordisk donerar 110 miljoner dollars till ett nytt centrum för proteinforskning i Köpenhamn, ett forskningsfält som ligger i tiden. Thomas skrev om det häromdan, och i dagens utgåva av Nature uppmärksammas centret.
Nature tar i sin nyhetsartikel bland annat upp den beräkningskapacitet som behövs för sådana här studier:
This technique, which smashes proteins into tiny fragments before reconstructing them by computer for identification and further study, benefits from the sort of large-scale computing power and bioinformatics capability a large centre can provide.
Jag tycker det är intressant att se att det inte bara är stora vetenskapliga centra som kan ge forskarna tillgång till sådan storskalig beräkningskapacitet. Ett exempel på Folding@Home, som använder en annan taktik (i brist på jätteanslag från finansiärer av typen Novo Nordisk, antar jag - men det verkar fungera ändå). Forskargruppen bakom Folding@Home är verksam på Stanford under ledning av Vijay Pande, och intresserar sig för att med hjälp av simuleringar som kräver stor datorkapacitet studera proteiner och deras dynamik, en fundamental del av biologin.
Pandegruppen använder distributed computing för att skapa datorkapaciteten. Distributed computing bygger, som bekant, på att människor frivilligt installerar mjukvara på sina PC:s och därmed donerar oanvända CPU-cykler till något projekt; tekniken börjar nu få några år på nacken. Det första omtalade projektet var Seti@home som lanserades i slutet av 1990-talet och många projekt var länge inom fysik och matematik. Men det som jag misstänkte för fyra år sedan har skett, livsvetenskaperna börjat knappa in - Folding@home är idag ett ledande distributed computing-project. De har varit framgångsrika på att bygga allmänhetens intresse. Istället för att leta efter radiosignaler från rymden (som det första framgångsrika storskaliga distributed computing-projektet, Seti@Home, gjorde), forskar gruppen på något som kan leda till bättre förståelse av ett flertal sjukdomar; sense-of-wonder-forskning slås alltså av relevansforskning. Framgången visar sig i antalet deltagare, totalt sett över två miljoner.
Och det går snabbt: i dagsläget är hastigheten 897 TFLOPS (att jämföra med Seti@Home som i dagsläget kommer upp i 286 TFLOPS). Det är, som man hävdade i ett pressmeddelande i slutet av mars, “the most powerful distributed computing resource on the planet, and for the calculations we run (parallel independent molecular dynamics trajectories), the most powerful supercomputer of any type (distributed or otherwise).” Till skillnad från en del andra distributed computing-projekt har man en icke obetydlig vetenskaplig output listan över papers som gruppen producerar visar om inte annat det.
Mötet och interaktionen mellan forskare och grupper utanför akademin är en faktor som ibland måste tas med för att förstå den vetenskapliga dynamiken; kommunikation med utomakademiska grupper bör ses som en del av den vetenskapliga praktiken. Det är en klassisk insikt inom modern vetenskapshistoria (modern är väl att ta i, för att beskriva ett resultat som är årtionden gammalt), men den går att applicera på dagens life sciences likaväl som på geologi i det tidiga 1800-talets England. Det är också intressant att se den institutionella innovationsförmåga som finns i Pangegruppen; att man klarar av att göra de här sakerna utan en stor mängd pengar att köpa superdatorer för.
Dessutom är den i snävt mening tekniska innovationspraktiken distribuerad: innovationer inom området sker delvis i interaktion med folk utanför Pandegruppen och utanför akademin. Den absoluta majoriteten av Folding@Homes användare är förstås passiva; vi kan inte göra något annat än att ladda ner skärmsläckaren och känna oss lite nöjda när vi tänker på den CPU-tid vi donerat till den bokstavligt talat livsviktiga proteinforskningen. Men en liten grupp avancerade användare tycks vara i samarbete med Pandegruppen; bland användarna finns folk som till vardags arbetar som programmerare, tex, och de preliminära data jag fått fram (det här är något som jag jobbat empiriskt med av och till en tid nu, ett av mina skrivbordsprojekt), visar att utvecklingen av mjukvara till projektet sker bland annat med hjälp av dessa “amatörer” (ordet använt i den äldre, icke-nedsättande meningen) donerar programmeringskunnande, avancerade insikter i CPU-teknik och annat, till gruppen.
Och där har vi en annan klassisk insikt, den om att innovationer och teknisk utveckling i vetenskapsrelaterade områden ibland sker i samarbete med “amatörer” och användare; den utomakademiska gruppen blir alltså inte bara “passiva” påhejare, leverantörer av politiskt och ekonomiskt stöd, utan ibland faktiska deltagare i den vetenskapliga praktiken och teknikutvecklingen. Men det visste ju vi vetenskapshistoriker redan.
American Chemical Society säger upp 36 iranska kemisters medlemskap, rapporterar Science. ACS hänvisar till det amerikanska embargot mot Cuba, Iran och Nordkorea, som enligt ACS gör det omöjligt att ha kvar de iranska medlemmarna.
Fysikerna, däremot, tycks göra en annan tolkning; American Physical Society, som också har iranska vetenskapsmän bland sina medlemmar, låter dessa stanna kvar.
senaste kommentarer